1. سپتیسمی باکتریال: عفونت خونی ناشی از باکتریهای بیهوازی.  
2. عفونتهای داخل شکمی: پریتونیت، آبسه شکمی.  
3. عفونتهای دستگاه تناسلی زنان: اندومتریت، آبسه لگنی.  
4. عفونتهای دستگاه تنفس تحتانی: پنومونی آسپیراسیون، آبسه ریوی.  
5. عفونتهای استخوان و مفاصل: عفونتهای ناشی از بیهوازیها.  
6. عفونتهای دندانی: عفونتهای شدید و آبسههای دهانی.  
7. عفونتهای پوستی و بافت نرم: عفونت نکروزان و محل جراحی.
1. آمیبیازیس: عفونت رودهای (اسهال خونی حاد) و کبدی (آبسه کبدی).  
2. ژیاردیازیس: درمان عفونت ناشی از ژیاردیا لامبلیا.  
3. تریکومونازیس: درمان بیماران و همسر آنها.  
4. Dientamoeba fragilis: درمان عفونت ناشی از این انگل (Off-label).  
5. بالانتیدیازیس: درمان عفونتهای ناشی از بالانتیدیوم کولی (Off-label).  
 
1. عفونت با کلستریدیوم دیفیسیل: درمان عفونتهای مرتبط با اسهال ناشی از آنتیبیوتیکها (Off-label).  
2. بیماری التهابی لگن (PID): درمان تجربی یا ترکیبی.  
3. واژینوزیس باکتریال: درمان عفونت ناشی از گاردنلا، هموفیلوس یا کورینهباکتریوم.  
4. پوچیت حاد: عفونتهای مربوط به جراحی روده (Off-label).  
5. هلیکوباکتر پیلوری: درمان در ترکیب با آموکسیسیلین و سایر آنتیبیوتیکها.  
6. کزاز: درمان عفونت ناشی از کلستریدیوم تتانی (Off-label).  
7. بیماری کرون: درمان کمکی برای فیستول پریآنال ساده (Off-label).  
1. آبسههای مغزی: درمان آبسه داخل جمجمهای و اپیدورال.
1. پیشگیری از عفونتهای جراحی: بهویژه در جراحیهای کولورکتال.  
2. عفونت گازگرفتگی انسان یا حیوان: پیشگیری یا درمان (Off-label).  
1- باکتریهای بیهوازی:
- باکتریوئیدها (Bacteroides):
مثال Bacteroides fragilis، که میتواند در عفونتهای داخل شکمی مانند آبسه شکمی یا پریتونیت دیده شود.  
- کلستریدیوم (Clostridium):  
 مثال: Clostridium difficile، عامل اسهال ناشی از آنتیبیوتیکها که مترونیدازول در درمان آن استفاده میشود.
- پپتوسترپتوکوکوس (Peptostreptococcus):  
مثال: در عفونتهای بیهوازی دندانی یا آبسههای دهانی نقش دارد.
- فوزوباکتریوم (Fusobacterium):
مثال: Fusobacterium necrophorum، که در عفونتهای ناشی از گازگرفتگی یا عفونت نکروزان مشاهده میشود.